Rada EkoFunduszu

Rada Fundacji określa kierunki działalności Fundacji, zatwierdza roczny plan finansowy, przyjmuje roczne sprawozdania z pracy EkoFunduszu, oraz powołuje i odwołuje jego Zarząd. Rada zatwierdza przyznanie pomocy finansowej dla poszczególnych projektów.
Rada Fundacji składa się z przedstawicieli Polski oraz reprezentantów krajów- donatorów. Przewodniczącego Rady mianuje Minister Środowiska a pozostałych członków Rady Minister Skarbu jako Fundator. 
Obecnie przewodniczącym Rady EkoFunduszu jest profesor Tomasz Żylicz.